Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmeff2Q9QYM9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms