Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VapbQ9QY76 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VapbQ9QY76 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VapbQ9QY76 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms