Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irx4Q9QY61 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms