Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms