Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg2Q9QXK3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg2Q9QXK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Copg2Q9QXK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms