Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Limd1Q9QXD8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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