Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc5Q9QX29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms