Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms