Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mid2Q9QUS6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid2Q9QUS6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms