Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk1eQ9JMK2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms