Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arl6ip4Q9JM93 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip4Q9JM93 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms