Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1aQ9JLR9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Higd1aQ9JLR9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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