Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gde1Q9JL56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms