Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc5a3Q9JKZ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc5a3Q9JKZ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms