Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp4Q9JKV5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms