Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms