Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nova1Q9JKN6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nova1Q9JKN6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms