Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrQ9JKK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AtrQ9JKK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms