Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcan3Q9JKK0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 914.2 ms