Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrip3Q9JJR9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms