Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms