Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1Q9JIT0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms