Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc22Q9JIG7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc22Q9JIG7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms