Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus3Q9JI38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus3Q9JI38 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms