Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz2Q9JHH9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz2Q9JHH9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms