Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms