Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rb1cc1Q9ESK9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rb1cc1Q9ESK9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms