Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms