Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dap3Q9ER88 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms