Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms