Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ropn1lQ9EQ00 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms