Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aph1cQ9DCZ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms