Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan4Q9DCK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms