Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd2Q9DBX3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd2Q9DBX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms