Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp27a1Q9DBG1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp27a1Q9DBG1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp27a1Q9DBG1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms