Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms