Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tysnd1Q9DBA6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tysnd1Q9DBA6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tysnd1Q9DBA6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms