Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR0

Uncharacterized protein C5orf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAR0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9DAR0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9DAR0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms