Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700018B08RikQ9DA83 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018B08RikQ9DA83 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms