Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms