Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9D9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D9D9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D9D9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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