Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco5aQ9D9D5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmco5aQ9D9D5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms