Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx5Q9D8U8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx5Q9D8U8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms