Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms