Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lin37Q9D8N6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lin37Q9D8N6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin37Q9D8N6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms