Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Derl3Q9D8K3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Derl3Q9D8K3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Derl3Q9D8K3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Derl3Q9D8K3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms