Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn9Q9D805 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn9Q9D805 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms