Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7R7

Pgc, Gastricsin, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgcQ9D7R7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PgcQ9D7R7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgcQ9D7R7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms