Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Capns2Q9D7J7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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