Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc94Q9D6J3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms